Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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TNFAIP1Q13829 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP1Q13829 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28■■■□□ 2.07
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TNFAIP1Q13829 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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TNFAIP1Q13829 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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TNFAIP1Q13829 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP1Q13829 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
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TNFAIP1Q13829 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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TNFAIP1Q13829 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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TNFAIP1Q13829 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP1Q13829 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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