Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms