Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB3Q13509 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB3Q13509 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB3Q13509 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms