Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GPM6BQ13491 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPM6BQ13491 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPM6BQ13491 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms