Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNTA1Q13424 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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