Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRSQ13332 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRSQ13332 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRSQ13332 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRSQ13332 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRSQ13332 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRSQ13332 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRSQ13332 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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