Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLAMF1Q13291 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLAMF1Q13291 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLAMF1Q13291 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms