Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTGDRQ13258 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGDRQ13258 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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