Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPA4Q13156 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPA4Q13156 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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