Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP4Q13115 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP4Q13115 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUSP4Q13115 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP4Q13115 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP4Q13115 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP4Q13115 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP4Q13115 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
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