Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFX1Q12986 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFX1Q12986 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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