Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF2Q12933 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF2Q12933 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms