Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMAN2Q12907 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN2Q12907 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN2Q12907 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN2Q12907 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN2Q12907 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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