Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD2Q12894 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFRD2Q12894 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD2Q12894 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms