Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN1Q12860 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN1Q12860 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN1Q12860 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms