Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXO1Q12778 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXO1Q12778 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXO1Q12778 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXO1Q12778 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXO1Q12778 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXO1Q12778 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXO1Q12778 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXO1Q12778 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXO1Q12778 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXO1Q12778 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXO1Q12778 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXO1Q12778 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXO1Q12778 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXO1Q12778 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXO1Q12778 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXO1Q12778 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXO1Q12778 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXO1Q12778 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXO1Q12778 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXO1Q12778 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXO1Q12778 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXO1Q12778 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXO1Q12778 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXO1Q12778 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXO1Q12778 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXO1Q12778 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXO1Q12778 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXO1Q12778 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXO1Q12778 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXO1Q12778 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXO1Q12778 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXO1Q12778 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXO1Q12778 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXO1Q12778 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXO1Q12778 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXO1Q12778 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXO1Q12778 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXO1Q12778 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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