Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC173Q0VFZ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms