Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDD7

C19orf57, Uncharacterized protein C19orf57, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf57Q0VDD7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C19orf57Q0VDD7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf57Q0VDD7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf57Q0VDD7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms