Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFFO1Q0D2I5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms