Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCBP1Q09161 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCBP1Q09161 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCBP1Q09161 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms