Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD300CQ08708 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD300CQ08708 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms