Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GOLGA3Q08378 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GOLGA3Q08378 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.39■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
GOLGA3Q08378 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms