Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSTF1Q05048 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms