Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCQQ04759 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCQQ04759 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCQQ04759 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms