Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAV1Q03135 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAV1Q03135 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAV1Q03135 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAV1Q03135 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAV1Q03135 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAV1Q03135 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAV1Q03135 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAV1Q03135 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms