Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP4Q02446 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP4Q02446 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP4Q02446 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SP4Q02446 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP4Q02446 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP4Q02446 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP4Q02446 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP4Q02446 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP4Q02446 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP4Q02446 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SP4Q02446 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SP4Q02446 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SP4Q02446 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP4Q02446 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP4Q02446 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP4Q02446 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP4Q02446 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SP4Q02446 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP4Q02446 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP4Q02446 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SP4Q02446 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SP4Q02446 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SP4Q02446 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP4Q02446 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP4Q02446 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP4Q02446 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP4Q02446 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SP4Q02446 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SP4Q02446 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP4Q02446 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP4Q02446 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SP4Q02446 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP4Q02446 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP4Q02446 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP4Q02446 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SP4Q02446 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SP4Q02446 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SP4Q02446 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SP4Q02446 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SP4Q02446 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP4Q02446 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP4Q02446 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP4Q02446 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP4Q02446 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP4Q02446 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SP4Q02446 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SP4Q02446 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP4Q02446 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP4Q02446 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP4Q02446 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP4Q02446 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP4Q02446 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP4Q02446 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP4Q02446 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP4Q02446 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP4Q02446 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP4Q02446 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP4Q02446 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP4Q02446 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP4Q02446 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP4Q02446 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP4Q02446 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP4Q02446 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP4Q02446 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP4Q02446 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP4Q02446 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms