Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRCDQ00LT1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRCDQ00LT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1120.9 ms