Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKB2Q00653 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms