Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL20P78556 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL20P78556 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL20P78556 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL20P78556 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL20P78556 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL20P78556 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL20P78556 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL20P78556 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL20P78556 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL20P78556 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCL20P78556 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL20P78556 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL20P78556 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL20P78556 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL20P78556 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL20P78556 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL20P78556 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL20P78556 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL20P78556 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms