Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEP78395 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEP78395 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms