Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRA2BP62995 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRA2BP62995 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms