Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2LP62875 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2LP62875 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2LP62875 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms