Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX4P57082 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX4P57082 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBX4P57082 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TBX4P57082 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX4P57082 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX4P57082 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX4P57082 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX4P57082 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX4P57082 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX4P57082 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBX4P57082 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBX4P57082 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX4P57082 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX4P57082 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX4P57082 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX4P57082 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX4P57082 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBX4P57082 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX4P57082 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX4P57082 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX4P57082 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX4P57082 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX4P57082 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBX4P57082 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX4P57082 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBX4P57082 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TBX4P57082 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TBX4P57082 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TBX4P57082 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TBX4P57082 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX4P57082 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX4P57082 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX4P57082 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX4P57082 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBX4P57082 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBX4P57082 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBX4P57082 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBX4P57082 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBX4P57082 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBX4P57082 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TBX4P57082 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBX4P57082 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBX4P57082 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBX4P57082 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX4P57082 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms