Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN8P56748 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN8P56748 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms