Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP1S2P56377 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP1S2P56377 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms