Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP1P56182 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP1P56182 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP1P56182 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP1P56182 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP1P56182 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP1P56182 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP1P56182 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP1P56182 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP1P56182 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP1P56182 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP1P56182 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP1P56182 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP1P56182 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP1P56182 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP1P56182 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP1P56182 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP1P56182 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP1P56182 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RRP1P56182 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RRP1P56182 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP1P56182 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP1P56182 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP1P56182 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP1P56182 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP1P56182 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP1P56182 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP1P56182 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP1P56182 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP1P56182 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP1P56182 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP1P56182 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP1P56182 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP1P56182 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP1P56182 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP1P56182 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP1P56182 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP1P56182 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP1P56182 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP1P56182 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP1P56182 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP1P56182 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP1P56182 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP1P56182 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP1P56182 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP1P56182 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP1P56182 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP1P56182 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP1P56182 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP1P56182 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP1P56182 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP1P56182 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP1P56182 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP1P56182 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP1P56182 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP1P56182 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP1P56182 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP1P56182 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP1P56182 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP1P56182 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRP1P56182 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRP1P56182 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRP1P56182 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRP1P56182 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRP1P56182 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RRP1P56182 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRP1P56182 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRP1P56182 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRP1P56182 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRP1P56182 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRP1P56182 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRP1P56182 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRP1P56182 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RRP1P56182 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRP1P56182 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRP1P56182 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms