Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AFDNP55196 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AFDNP55196 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AFDNP55196 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AFDNP55196 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AFDNP55196 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AFDNP55196 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AFDNP55196 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AFDNP55196 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AFDNP55196 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
AFDNP55196 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AFDNP55196 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AFDNP55196 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AFDNP55196 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AFDNP55196 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AFDNP55196 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AFDNP55196 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AFDNP55196 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AFDNP55196 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AFDNP55196 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AFDNP55196 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
AFDNP55196 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AFDNP55196 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AFDNP55196 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AFDNP55196 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
AFDNP55196 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
AFDNP55196 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AFDNP55196 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AFDNP55196 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
AFDNP55196 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
AFDNP55196 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
AFDNP55196 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
AFDNP55196 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AFDNP55196 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AFDNP55196 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
AFDNP55196 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
AFDNP55196 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
AFDNP55196 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AFDNP55196 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AFDNP55196 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AFDNP55196 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AFDNP55196 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AFDNP55196 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AFDNP55196 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AFDNP55196 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AFDNP55196 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AFDNP55196 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AFDNP55196 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AFDNP55196 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AFDNP55196 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AFDNP55196 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AFDNP55196 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AFDNP55196 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AFDNP55196 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AFDNP55196 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
AFDNP55196 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AFDNP55196 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AFDNP55196 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AFDNP55196 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
AFDNP55196 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AFDNP55196 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
AFDNP55196 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AFDNP55196 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AFDNP55196 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
AFDNP55196 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AFDNP55196 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AFDNP55196 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AFDNP55196 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
AFDNP55196 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFDNP55196 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFDNP55196 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
AFDNP55196 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFDNP55196 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFDNP55196 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFDNP55196 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFDNP55196 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
AFDNP55196 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AFDNP55196 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AFDNP55196 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AFDNP55196 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AFDNP55196 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AFDNP55196 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AFDNP55196 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AFDNP55196 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
AFDNP55196 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AFDNP55196 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AFDNP55196 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AFDNP55196 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AFDNP55196 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
AFDNP55196 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AFDNP55196 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms