Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H2P55055 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NR1H2P55055 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H2P55055 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms