Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP12AP54707 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP12AP54707 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms