Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSCP53634 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSCP53634 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSCP53634 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSCP53634 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSCP53634 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSCP53634 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSCP53634 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSCP53634 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSCP53634 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSCP53634 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSCP53634 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSCP53634 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSCP53634 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSCP53634 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSCP53634 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSCP53634 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSCP53634 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSCP53634 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSCP53634 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSCP53634 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSCP53634 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSCP53634 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSCP53634 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSCP53634 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSCP53634 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSCP53634 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSCP53634 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSCP53634 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSCP53634 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSCP53634 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSCP53634 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSCP53634 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSCP53634 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSCP53634 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSCP53634 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSCP53634 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSCP53634 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSCP53634 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSCP53634 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSCP53634 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSCP53634 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSCP53634 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSCP53634 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSCP53634 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSCP53634 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSCP53634 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSCP53634 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSCP53634 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSCP53634 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSCP53634 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSCP53634 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSCP53634 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSCP53634 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSCP53634 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSCP53634 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSCP53634 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSCP53634 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSCP53634 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSCP53634 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSCP53634 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSCP53634 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSCP53634 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSCP53634 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSCP53634 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSCP53634 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSCP53634 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSCP53634 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSCP53634 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSCP53634 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSCP53634 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms