Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPAP53621 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPAP53621 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPAP53621 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPAP53621 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPAP53621 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPAP53621 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPAP53621 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPAP53621 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPAP53621 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPAP53621 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPAP53621 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPAP53621 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPAP53621 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPAP53621 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPAP53621 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COPAP53621 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPAP53621 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPAP53621 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPAP53621 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPAP53621 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPAP53621 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPAP53621 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPAP53621 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPAP53621 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPAP53621 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPAP53621 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPAP53621 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COPAP53621 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPAP53621 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPAP53621 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPAP53621 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPAP53621 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPAP53621 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPAP53621 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPAP53621 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPAP53621 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPAP53621 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPAP53621 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPAP53621 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPAP53621 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPAP53621 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPAP53621 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPAP53621 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPAP53621 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPAP53621 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COPAP53621 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPAP53621 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPAP53621 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPAP53621 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms