Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP1P53367 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP1P53367 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms