Protein–RNA interactions for Protein: P53259

PCP1, Rhomboid protein 1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PCP1	P53259	YCR047W-A	YCR047W-A	207 nt		4.99	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		4.99	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	PAN6	YIL145C	930 nt		4.99	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	ERP2	YAL007C	648 nt		4.99	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	NAT5	YOR253W	531 nt		4.99	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	DSE3	YOR264W	1293 nt		4.99	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	PEX32	YBR168W	1242 nt		4.99	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	AVO1	YOL078W	3531 nt		4.98	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	QRI1	YDL103C	1434 nt		4.98	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	APN1	YKL114C	1104 nt		4.98	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	MRPL22	YNL177C	930 nt		4.98	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	YEH1	YLL012W	1722 nt		4.97	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	VPS5	YOR069W	2028 nt		4.97	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	PAT1	YCR077C	2391 nt		4.97	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	RIO1	YOR119C	1455 nt		4.97	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	YCL065W	YCL065W	369 nt		4.97	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	YHR095W	YHR095W	495 nt		4.97	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	RPR2	YIR015W	435 nt		4.97	□□□□□ -1.61
PCP1	P53259	RAP1	YNL216W	2484 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	PRP46	YPL151C	1356 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	YRA1	YDR381W	681 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	YGR022C	YGR022C	330 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	YNR075C-A	YNR075C-A	93 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	YOL035C	YOL035C	303 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	PDB1	YBR221C	1101 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	UGO1	YDR470C	1509 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	RSC30	YHR056C	2652 nt		4.96	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	NOG2	YNR053C	1461 nt		4.95	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	MID1	YNL291C	1647 nt		4.95	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	OAC1	YKL120W	975 nt		4.95	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	NPT1	YOR209C	1290 nt		4.95	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	YRF1-4	YLR466W	4149 nt		4.95	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	ORC5	YNL261W	1440 nt		4.95	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	NUP1	YOR098C	3231 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	AAD6	YFL056C	639 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	RPL7A	YGL076C	735 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	MRP17	YKL003C	396 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	COX17	YLL009C	210 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	OSW5	YMR148W	447 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	GFD1	YMR255W	567 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	RPC19	YNL113W	429 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	RPL7B	YPL198W	735 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	NHP6B	YBR089C-A	300 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	SHM1	YBR263W	1473 nt		4.94	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	SMF2	YHR050W	1650 nt		4.93	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	GEX2	YKR106W	1848 nt		4.93	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	YDL057W	YDL057W	987 nt		4.93	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	HST4	YDR191W	1113 nt		4.93	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	YKL031W	YKL031W	414 nt		4.93	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	LST8	YNL006W	912 nt		4.93	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	MLC2	YPR188C	492 nt		4.93	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	CLD1	YGR110W	1338 nt		4.93	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	BRL1	YHR036W	1416 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	SSK22	YCR073C	3996 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	RHB1	YCR027C	630 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	YDR154C	YDR154C	351 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	SNZ3	YFL059W	897 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	MMS2	YGL087C	414 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	HCR1	YLR192C	798 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	SNZ2	YNL333W	897 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	ARR3	YPR201W	1215 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	RSA4	YCR072C	1548 nt		4.92	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	SLD2	YKL108W	1362 nt		4.91	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	GUA1	YMR217W	1578 nt		4.91	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	ATP1	YBL099W	1638 nt		4.91	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	PIC2	YER053C	903 nt		4.91	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	RKM4	YDR257C	1485 nt		4.91	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	FRE7	YOL152W	1863 nt		4.91	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	SVF1	YDR346C	1446 nt		4.9	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	HSF1	YGL073W	2502 nt		4.9	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	SLX5	YDL013W	1860 nt		4.9	□□□□□ -1.62
PCP1	P53259	DCN1	YLR128W	810 nt		4.9	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	SEC17	YBL050W	879 nt		4.9	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	TRP5	YGL026C	2124 nt		4.9	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	QNS1	YHR074W	2145 nt		4.9	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	HXT2	YMR011W	1626 nt		4.9	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	YBR284W	YBR284W	2394 nt		4.9	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	SPO77	YLR341W	1434 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	IMG2	YCR071C	441 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	IDP1	YDL066W	1287 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	IPK1	YDR315C	846 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	ARP1	YHR129C	1155 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	ADD37	YMR184W	597 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	YNL108C	YNL108C	813 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	YBL081W	YBL081W	1107 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	RPS15	YOL040C	429 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	YOL131W	YOL131W	327 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	RBD2	YPL246C	789 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	MRPL36	YBR122C	534 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	PYC1	YGL062W	3537 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	HOS1	YPR068C	1413 nt		4.89	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	ATG32	YIL146C	1590 nt		4.88	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	ADY2	YCR010C	852 nt		4.88	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	YDR541C	YDR541C	1035 nt		4.88	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	YEL028W	YEL028W	462 nt		4.88	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	YGL118C	YGL118C	438 nt		4.88	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	EFM4	YIL064W	774 nt		4.88	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	LAP2	YNL045W	2016 nt		4.88	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	CLB1	YGR108W	1416 nt		4.88	□□□□□ -1.63
PCP1	P53259	YKR075C	YKR075C	924 nt		4.87	□□□□□ -1.63

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