Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF143P52747 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF143P52747 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms