Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNHP51946 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNHP51946 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNHP51946 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNHP51946 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNHP51946 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNHP51946 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNHP51946 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNHP51946 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNHP51946 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNHP51946 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNHP51946 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNHP51946 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNHP51946 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNHP51946 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNHP51946 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNHP51946 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNHP51946 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNHP51946 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNHP51946 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNHP51946 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNHP51946 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNHP51946 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNHP51946 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNHP51946 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNHP51946 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNHP51946 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNHP51946 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCNHP51946 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNHP51946 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNHP51946 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNHP51946 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNHP51946 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNHP51946 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNHP51946 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNHP51946 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNHP51946 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNHP51946 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNHP51946 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms