Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCNN1GP51170 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCNN1GP51170 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms