Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8P50990 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8P50990 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8P50990 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8P50990 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8P50990 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8P50990 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8P50990 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8P50990 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8P50990 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8P50990 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8P50990 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8P50990 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8P50990 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8P50990 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8P50990 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8P50990 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8P50990 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8P50990 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8P50990 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8P50990 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8P50990 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8P50990 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8P50990 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8P50990 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8P50990 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8P50990 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8P50990 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8P50990 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8P50990 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8P50990 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8P50990 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8P50990 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8P50990 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8P50990 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8P50990 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8P50990 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8P50990 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8P50990 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8P50990 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8P50990 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8P50990 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8P50990 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8P50990 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8P50990 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8P50990 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8P50990 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms