Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRE11P49959 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRE11P49959 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRE11P49959 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRE11P49959 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRE11P49959 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRE11P49959 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRE11P49959 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRE11P49959 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRE11P49959 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRE11P49959 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRE11P49959 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MRE11P49959 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRE11P49959 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRE11P49959 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRE11P49959 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRE11P49959 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRE11P49959 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRE11P49959 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRE11P49959 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRE11P49959 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRE11P49959 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRE11P49959 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MRE11P49959 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MRE11P49959 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRE11P49959 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MRE11P49959 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MRE11P49959 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MRE11P49959 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRE11P49959 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRE11P49959 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRE11P49959 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRE11P49959 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRE11P49959 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRE11P49959 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRE11P49959 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRE11P49959 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRE11P49959 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRE11P49959 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRE11P49959 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRE11P49959 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRE11P49959 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRE11P49959 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRE11P49959 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRE11P49959 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRE11P49959 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRE11P49959 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRE11P49959 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRE11P49959 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRE11P49959 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRE11P49959 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRE11P49959 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRE11P49959 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRE11P49959 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MRE11P49959 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MRE11P49959 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MRE11P49959 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRE11P49959 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRE11P49959 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MRE11P49959 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRE11P49959 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRE11P49959 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRE11P49959 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRE11P49959 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRE11P49959 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRE11P49959 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRE11P49959 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRE11P49959 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRE11P49959 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRE11P49959 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms