Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK1P49759 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK1P49759 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK1P49759 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK1P49759 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK1P49759 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK1P49759 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK1P49759 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK1P49759 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK1P49759 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK1P49759 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK1P49759 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK1P49759 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK1P49759 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK1P49759 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLK1P49759 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLK1P49759 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLK1P49759 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK1P49759 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK1P49759 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK1P49759 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK1P49759 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK1P49759 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLK1P49759 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK1P49759 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK1P49759 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK1P49759 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK1P49759 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK1P49759 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK1P49759 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK1P49759 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK1P49759 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK1P49759 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK1P49759 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK1P49759 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK1P49759 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK1P49759 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK1P49759 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK1P49759 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK1P49759 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK1P49759 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK1P49759 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK1P49759 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK1P49759 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK1P49759 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK1P49759 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK1P49759 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK1P49759 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK1P49759 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK1P49759 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK1P49759 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK1P49759 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK1P49759 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK1P49759 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK1P49759 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK1P49759 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK1P49759 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK1P49759 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK1P49759 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK1P49759 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms