Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT3P49368 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT3P49368 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT3P49368 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT3P49368 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT3P49368 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT3P49368 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT3P49368 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT3P49368 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT3P49368 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT3P49368 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCT3P49368 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT3P49368 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT3P49368 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT3P49368 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT3P49368 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT3P49368 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT3P49368 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT3P49368 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT3P49368 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT3P49368 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT3P49368 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT3P49368 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCT3P49368 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCT3P49368 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT3P49368 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT3P49368 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT3P49368 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT3P49368 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT3P49368 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT3P49368 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT3P49368 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT3P49368 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT3P49368 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT3P49368 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT3P49368 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT3P49368 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT3P49368 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT3P49368 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT3P49368 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT3P49368 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT3P49368 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT3P49368 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT3P49368 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT3P49368 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT3P49368 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCT3P49368 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCT3P49368 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCT3P49368 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCT3P49368 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT3P49368 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT3P49368 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT3P49368 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT3P49368 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT3P49368 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCT3P49368 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCT3P49368 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms